Terceira Temporada

• 53 - Direto ao Coração
• 54 - Um Lyoko a Menos (Ocorre a destruição da região da floresta)
• 55 - Onda Fatal
• 56 - Falso Líder
• 57 - Aelita
• 58 - O Pretendente (Ocorre a destruição da região do deserto)
• 59 - O Segredo
• 60 - Insanidade Temporária
• 61 - Sabotagem (Ocorre a destruição da região do gelo)
• 62 - Ninguém em Particular
• 63 - Três é Demais!
• 64 - Problemas à Dobrar (Ocorre a destruição da região das montanhas)
• 65 - A Batalha Final (Ocorre a destruição de Lyoko)